Laboratorium atau pusat komputer yang terletak di tengah Kampus Universitas Trunojoyo mengelola dan mengembangkan mata kuliah komputer di lingkungan Universitas, kursus-kursus dan pelatihan dengan sarana yang cukup memadai.
Baca juga: Belasan Mahasiswa Universitas Trunojoyo Madura Putus Kuliah Karena Tak Mampu Bayar UKT
d. Laboratorium Bahasa
Bahasa merupakan kunci dalam mempelajari ilmu pengetahuan sehingga diperlukan penguasaan bahasa Inggris yang memadai. Beberapa kegiatan yang telah dilakukan oleh Labortorium Bahasa antara lain penyelenggaraan praktikum untuk mata kuliah Bahasa Inggris dan pelaksanaan kursus Bahasa Inggris untuk mahasiswa dan dosen. Laboratorium Bahasa pada saat ini telah dilengkapii dengan Self Accesss Centre sehingga mahasiswa dan dosen mempuyai peluang yang lebih banyak dan leluasa mengatur waktu serta materi pembelajaran bahasa Inggris mereka.
e. Laboratorium Dasar
1. Laboratorium Kimia
Laboratorium kimia mendukung aktifitas perkuliahan kimia anorganik, kimia organik dan biokimia, yang dilengkapi dengan alat-alat : alat destiliasi, alat filtrasi, desikator dan alat pengujian kimiawi lain.
2. Laboratorium Fisika
Laboratorium fisika mendukung aktifitas perkuliahan yang berkaitan dengan materi fisika. Yang dilengkapi dengan alat-alat : pengujian optis, fisik, mekanis maupun elektronik. Laboratorium ini digunakan untuk kegiatan praktikum mahasiswa Fakultas Teknik dan Fakultas Pertanian.
3. Laboratorium Biologi
Laboratorium ini mendukung aktifitas perkuliahan mata kuliah biologi umum, botani dan mikrobiologi.
d. Laboratorium yang terdapat di Fakultas Hukum adalah Laboratorium Hukum dan Pusat Dokumentasi Ilmu Hukum (Lab Hukum&PDIH).
Lab Hukum&PDIH memiliki dua fungsi utama. Fungsi pertama adalah menyediakan koleksi khusus buku-buku penunjang Ilmu Hukum, ruang baca serta komputer yang digunakan mahasiswa untuk mengerjakan tugas-tugas perkuliahan dan mengakses internet. Fungsi kedua adalah memfasilitasi mata kuliah Praktek. Mata kuliah yang dikelola langsung oleh Lab Hukum&PDIH adalah Magang. Selain itu, Lab Hukum&PDIH juga menyediakan sarana ruang peradilan semu (moot court) bagi mahasiswa yang memprogram mata kuliah praktek peradilan baik Praktek Peradilan Tata Usaha Negara (PTUN), Peradilan Perdata maupun Peradilan Pidana. Selain itu, Lab Hukum&PDIH juga memfasilitasi praktek kemahiran hukum lainnya serta menyelenggarakan Praktek Kerja Lapangan.
g. Laboratorium Pada Fakultas Ekonomi
Laboratorium ini digunakan untuk mendukung proses pembelajaran di 3 (tiga) program studi yaitu prodi Manajemen, Akutansi dan Ekonomi Pembangunan. Adapun laboratorium yang tersedia adalah sebagai berikut:
1. Laboratorium Pasar Modal